Από την αρχή της λειτουργίας του το Κ.Δ.Α.Π. έχει αναπτύξει έντονη δραστηριότητα στον τομέα των εκπαιδευτικών προγραμμάτων. Προετοιμάζει και υλοποιεί εκπαιδευτικά προγράμματα που αφορούν στην ιστορία, την αρχαιολογία και την ιστορία της τέχνης. Τα προγράμματα απευθύνονται σε όλες τις βαθμίδες της εκπαίδευσης.

Τα εκπαιδευτικά προγράμματα είναι τα εξής: